该作继续了原版的故事剧情，并在原版基础上添加了将军挑战模式。每个将军都要在最后挑战最终Boss，—个隐藏的中国将军——凌将军。游戏添加了9个将军阵营，共12个阵营，也新增加了些单位、建筑、 背景设定
不同于“泰伯利亚”以及“红色警戒”系列，
《命令与征服：将军》是全新的剧情。采用名为SAGE（StrategyAction Game Engine）的游戏引擎，例如美国的雷射将军能够建造雷射炮塔以及激光坦克，绝命时刻里也新增了真人过场动画，在单人任务开始前以新闻报道的方式呈现。将军系列有三大阵营，以强大的科技和辅助单位著称的美国，拥有强大的重型武力的中国以及擅长游击战的全球解放军（Global Liberation Army，GLA）。游戏中美国和中国是全球解放军所要击败的目标，而美国以先进的科技如空中支援及粒子炮来对抗，中国则有重型常规武器 